干細胞按發育潛能劃分，可分為全能干細胞、多能干細胞和專能干細胞。
全能干細胞：具有形成完整個體的分化潛能，如胚胎干細胞(ES)具有很強的分化能力，可無限增殖并分化為全身200多種細胞類型及機體的各種組織、器官。
多能干細胞：具有分化出多種細胞組織的潛能，但失去了發育成完整個體的能力。如骨髓多能造血干細胞，它可分化出至少十二種血細胞，但不能分化出造血系統以外的其它細胞。
專能干細胞：也稱單能干細胞，這類干細胞只能向一種類型或密切相關的兩種類型的細胞分化。如上皮組織基底層的干細胞、肌肉中的成肌細胞。
